首先要看孩子感染的是哪种衣原体，如果是由于肺炎衣原体感染的，一般以呼吸道症状为主，其中最常见的就是肺炎、支气管炎、咽炎、喉炎等等。主要表现的症状有发热、咳嗽、咽喉疼痛、声音嘶哑、全身不适等。如果是由沙眼衣原体感染的，一般婴幼儿感染多可以表现为眼部的结膜炎。儿童起病一般是一个急性的感染过程，可以自行环节，不会留后遗症。而新生儿通过产道感染沙眼衣原体之后，可能会出现急性或者亚急性疾病。开始的时候表现眼部有少量的黏液性分泌物，随后黏液性分泌物逐渐增多，持续2-3个月之后会出现乳白色的、光泽的滤泡，严重的孩子可能会出现假膜或者结膜的瘢痕化。还有一部分会出现泌尿系统的感染，而出现导致衣原体性的尿路感染性炎症，主要孩子表现为尿频、尿急、排尿痛等。
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