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如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列

2023-11-26 03:10:32 编辑:join 浏览量:599

如何在uniprot数据库中查找某个蛋白序列

NCBINCBI下有很多数据库,守量结治演食含脱院儿以下是蛋白质序列PopSet包括研究1个人群、1个种系产生或描写人群变化的1组组联合序列。PopSet既包括核酸序列数据又包括蛋白质序列数据来自。Entrez功能强大,在于它的大多数记录可相互链接,既可在同1数据库内链接,也可在数据库之间进行链接。当应用BLAST软件比较某氨基酸或DNA序列与库中其他氨基酸或DNA序列360问答差异即进行类似性检索时,则会触及到蛋白质库或核苷酸库的库内链接。库间链接产生在核苷酸数据库内的记录与PubMed库中已发表序列的引文间的链接,或蛋白质序列记录与核苷酸序列库中编码它的核苷酸序列间的链接。BLAST(BasicLocalAlignmentSearchTool)是用于序列类似性检索的1个重要数据库,是辨别基因和基因特点的工具。该软件能在15秒内完成全部DNA数据库临衣笑少训补管的序列检索。BLAST记录的相干度有明确的统计学解释,以便更容易地将相干记录与随机的数据库记录像辨别。在NCBI主页的左工具条中,点击BLAST图标,即进入BLAST主页。BLAST主页提供了几种BLAST检索软件。其中BLAST2.0是1种新的BLAST检索工具,它在原有基础上作了改进,运行速度更快,灵敏度更高,同时具有GappedBLAST和PSI-BLAST两种软件的新功能。GappedBLAST允许在对准的序列中引入空位(碱基缺失或插入备),引入空位(Gaps)意味着在比较两去首分刚划燃景客核个相干序列时不会出现中断(Brea青矿个确妈单具k)现象。这些空位对准的记分系统更能反应相干序列群的类似程度。PSI-BLAST的全称是Position-SpecificIteratedBALST,即特殊位置重复BLAST,它提供了自动、早挥侵象测济易用的概貌(Profile)检索,是查找序列同源的有效工具。Dnastar可村新阿行充以用于解决你踢完的局住供学后半个问题

标签:uniprot,查找,数据库

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