真菌是不耐热的，140℃时大部分真菌会在短时间内死亡，但在低温条件下真菌可以长期存活。紫外线和X射线均不能杀灭真菌，但甲醛、苯酚、碘酊和过氧乙酸等化学消毒剂均能迅速杀灭真菌。
真菌感染时物品消毒只需要煮沸消毒，或浸泡在甲醛、苯酚、过氧乙酸等化学消毒剂里就能彻底消灭真菌。
皮肤黏膜的真菌要外用抗真菌药物，包括抗真菌溶液、擦剂以及粉剂、药膏都有杀灭真菌的作用。
如果是比较严重的真菌感染，在外用药的基础上、消毒物品的基础上，还要口服抗真菌药物。
总之，真菌的消灭方法，针对物品以及人体有所不同。
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