福建中医药大学药学院的前身为福建中医学院中药系,办学历史可追溯到学校创办之初。1958年我校建校之初就成立了本草学教研组,1984年成立中药系筹备组,1985年1月招收中药专科进修班,成为我校药学办学的开端。1985年秋季招收第一届中药学专科生,1992年开始招收中药学本科生,是福建省创办最早的药学类专业的本科院校。2000年更名为药学系并招收第一届药学专业本科生,2002年开始招收中药学硕士研究生。2010年随着福建中医学院更名为福建中医药大学,药学系亦更名为福建中医药大学药学院。
药学院有中药学、药学、药物制剂、制药工程、市场营销、食品科学与工程等6个本科专业;药学、中药学两个一级学科硕士点(含学术型和专业型),药学一级学科硕士点下设药物化学、药理学、药物分析学、药剂学、社会发展与药事管理学等二级学科。
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