生理性口臭是由于饥饿食用了某些药物或者洋葱、大蒜等刺激性食物，抽烟，睡眠时唾液分泌量减少所致的细菌大量分解食物残渣都可能引起短暂的口臭。
病理性口臭分为口源性口臭和非口源性口臭两类，据统计80%到90%的口臭是来源于口腔，口腔中有未治疗的龋齿、残根、残冠、不良修复体、不正常解剖结构、牙龈炎、牙周炎以及口腔黏膜病等，都可以引起口臭。
其中龋齿和牙周疾病又是最常见的相关疾病。
非口源性口臭如口腔邻近组织疾病、化脓性扁桃体炎、慢性上颌窦炎、萎缩性鼻炎等，可以产生脓性分泌物而发出臭味。
临床上常见的内科疾病如急慢性胃炎、消化性溃疡出现酸臭味;幽门梗阻、晚期胃癌常出现臭鸭蛋性口臭。
糖尿病酮症酸中毒患者可以呼出丙酮味的气体，尿毒症患者呼出烂苹果气味。
另外，白血病、维生素缺乏、重金属中毒等都可引起口臭。
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