有很多显著改动，总的来说要更加合理，人物塑造和剧情架构也更饱满。(总之可以看做完美重制版)
全凭记忆……很多细节都不记得了，有的描述可能和实际剧情有出入。
关于前传之类的东西就不多介绍了，自行去看GTO动画即可，或者原作9-10卷。
1.白色基地降落地球之后的行进路线有了变化。原0079先是降落到北美，然后横穿太平洋，中亚，途径敖德萨，并参与了对矿山基地的攻击和敖德萨战役，之后来到贝尔法斯特，最后跨越大西洋来到加布罗。在这一旅途中陆续干掉了卡尔玛，兰巴拉尔和黑色三连星一票dalao。
而GTO版则是直接从北美南下，纵贯南美大陆，中途干掉卡尔玛，兰巴拉尔和黑色三连星，然后来到位于圭亚那高地岩层下的加布罗基地，中途参与了加布罗防卫战(因为高达整修的缘故，阿姆罗在这里开吉姆出战了，顺便给吉姆投入实战做了铺垫)，最后去参加敖德萨。另外骡子似乎和黑三见过面，后来黑三在马修死后还补充了兵员，不过最终难逃一死。
值得注意的是，敖德萨战役和加布罗攻防战的顺序发生了改变。
原0079：联邦军集中庞大规模的兵力发动了敖德萨战役，成功扭转了战争局势，吉翁地上军开始溃败，然后孤注一掷地对加布罗发动奇袭，最终失败，也宣告了吉翁军地球战略的彻底溃败。在这条世界线里，联邦军的吉姆只有少量投入了敖德萨战线。
GTO：吉翁摸到了加布罗的入口，并发动奇袭，然后发现联邦军的量产MS已经开始投入生产，最终惨败，士气大跌，而联邦这边则提振了信心，并发动了敖德萨战役，一举粉碎了吉翁地上军的基盘，在这条世界线里，吉姆从测试到量产到投入战线，有一个较清晰的过程。
2.马克贝的最终命运。
嗯……在GTO里马克贝的官阶被提到了中将(原0079是中校)，作为地球方面军重要负责人之一，算是比较合理。
0079动画版当中，因为敖德萨溃败而失宠，急于和夏亚争功的马克贝在德克萨斯殖民卫星与高达单挑，最终被击破，马克贝死亡。
0079剧场版：这一剧情被省略。
GTO：马克贝在敖德萨战役最后，带着一大批扎古II和老虎发动决死特攻，近距离肉搏，最终沉入湖底自爆，死的很壮烈。
北爪宏幸的CDA：在阿巴瓦库战役最后掩护瑟娜和密涅瓦跑路，被联邦军击破。
在GTO当中，马克贝被塑造成了一个更加冷静，睿智的形象，最后一刻也是带着部下死战到底，颇有名将风范。尽管是紫色老太婆的入幕之宾，但能够掌管地球上的大批矿山，为吉翁提供了大量战争资源，还主导了“统合整备计划”的表现来看(这个其实是擦屁股)，马克贝绝不是一个纯粹自私自利的阴险小人。
3.阿巴瓦库战役的设定：
吉翁在阿巴瓦库战役中集结了包括两艘多洛斯级巨型航空母舰在内的全部精锐主力。但联邦这边更加可怖——毕竟原型是二战美国，尽管付出了沉痛损失(卫星炮轰击摧毁了大量舰艇，雷比尔将军也战死了，在攻防战过程中也损失了大量兵力)，钢铁洪流最终毫无悬念地淹没了阿巴瓦库要塞。而在GTO的故事当中，双方的差距就没那么悬殊了，联邦军吃到了更大的苦头，并且…似乎也是一次性集中了优势兵力。两艘多洛斯带来的威压感是极为恐怖的。华肯也是在攻打多洛斯的时候战死的。
塞拉驾驶装甲强化型的吉姆出击，最终被击破，并漂流到阿巴瓦库要塞内部，被俘虏。危机之时说出了自己身为国父吉翁.戴肯之女的身份，导致吉翁侧军心动摇，陷入内乱，紫色老太婆气的七窍生烟。联邦军随后发动了登陆攻势。
4.人物：
原0079里，阿姆罗仿佛有神力加持，量子波动速读了一次说明书之后就成功开上了高达。GTO里则做了补充解释，毕竟骡子爹是V计划的主管人员，而骡子也是长年累月地偷偷接触相关的东西，自然对高达的操纵方式有了解，后来还被安全部门查了一次水表。
原0079里，林有德只有19岁，士官候补生。GTO里则是24岁(不是学生)。
紫色老太婆看着像个BBA，但在原0079里也就20多岁，GTO里则变成了30多岁。
鸭子的出生年龄似乎提前了？(0058年)接生婆是克劳雷.哈蒙。
吉翁.戴肯和德金.扎比是大学教授。
嗯…突然想起了CCA里夏亚与阿姆罗在阿克西斯内部的那段对话：
“ 革命总是由知识分子发起的，但因为怀着梦想般的目标，总是只会做些过于激进的举动，但是当革命之后，就算是纯洁的革命精神，也会被官僚主义和大众所吞没…… ”
再回顾吉翁.戴肯的一生，以及那个以他为名的太空殖民地国家，从兴盛，变质，走向疯狂到毁灭的历史，还真是别有意味。
5.机设：
机设细节有很多变动。
RTX-65早期型钢坦克，以及一票早期型钢加农之类就不多提了，看过动画的应该都知道。联邦军在一年战争之前就开始了MS的开发，但是思路不对……钢坦克仍然属于战车的范畴，而钢加农也就是个两脚坦克，泛用性机动性都不行，然后在月球的史密斯海被扎古暴打……(这个真不是今西黑联邦的锅，GTO原作就这样设定的)
然后就有了V计划，有了高达。顺便，GTO的V计划只有高达(后来衍生出吉姆)，钢加农和钢坦克被排除。
高达的编号变化就不用我多说了，RX-78-01，RX-78-02等。根据GTO MSD来看，FA78之类的改型的也存在。
RX-78-01的头部取景器是整块的镜片形式，类似于吉姆。78-02则变成了双眼，不过成本太高，后来量产吉姆的时候又变回了整块镜片。
高达的核心战机机构被取消，在白色基地来到加布罗之后增加了核心逃生机(一个位于躯干的小型飞行器，类似于逃生舱，仅能自卫)。
原0079动画里那一票为了卖玩具出的辅助组件，被取消了。(事实上，在0079剧场版里，G-Bull就换成了核心喷射机)
高达经历了数次改装(加布罗一次，所罗门一次)，每次改装都有外观上的变化，武器也有改变(光束步枪换了两种)。此外还增加了包括固定机枪(非头部火神炮)，肩部短管加农炮等武器，流星锤好像被取消了。
原0079由大河原老师设计的素吉姆，外形实在是过于简陋……而且长得很受气包(一直延续到吉姆II，导致后来Ka设计的0083版吉姆C显得格外突兀)。GTO的吉姆增加了很多细节，虽然依旧是杂兵。
白色基地上宇宙时得到了两台装甲强化型吉姆的增援，各项性能显著增强，并且配备了核心逃生机，一台由塞拉驾驶，另一台有乔布.约翰驾驶(金发美少年，F90高达的设计师)。
吉翁系MS的开发系谱有所改变。
原UC宇宙的设定为MS-01→MS-02→MS-03→MS-04原型扎古→MS-05扎古I。
GTO设定为MW-01机动工兵→MS-03瓦夫→MS-04布古→MS-05扎古I。不过不知道GTO世界观里会不会有EMS-04兹达(笑
大猩猩在原0079里是舰队派，在鲁姆战役之前轻视MS的作用，但在GTO设定里，大猩猩是MS开发的坚定支持者。
扎古II的120mm机关枪实在是太有名了……使用弹盘式供弹机构，并延续到后来的MMP78上面。而在GTO里，扎古机枪使用的是弹链供弹，机枪通过弹链与背后的弹药包连接，有点像提坦斯的RMS-141赛克.艾恩实弹武装型？
老虎，大魔的科技树有些许变化。
GTO设定当中，MS-06R1高机动扎古在鲁姆战役就有登场，由黑色三连星驾驶。
而在原UC设定里，MS-06R1的服役要等到一年战争中期了，但确实是有黑三专用机的(详见MSV和基连野望)。而在鲁姆战役期间，黑三驾驶的是MS-05B，俘虏了雷比尔将军。
MS-11机动扎古似乎成了量产机(原UC设定当中，MS-11有少量生产，战后被联邦接收，然后被提坦斯所用)。
战蟹，龟霸与魔蟹的机设有较大的变化。
联邦军在麦哲伦级战舰，萨拉米斯级巡洋舰之外，还多了一种勒班陀级驱逐舰。(虽然萨拉米斯冠着巡洋舰的头衔，但一直干的是驱逐舰的活儿)
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