1904年改为直隶高等农业学堂，直隶清政府学部管理。1912年学校改为直隶公立农业专门学校。
1921年9月，驻保直系军阀直鲁豫巡阅使曹锟奉北洋政府教育部令，将直隶公立农业专门学校、医务学堂，还有法律、法政、高等师范等学堂合并，组成河北省*所综合性的大学——河北大学。首任校长由曹锟之弟直隶省长曹锐兼任。当时的河北大学以农科为主，专业设置为林学、农学、园艺三个系，学制四年。
1931年河北大学解散后，省立农学院仍独立办学，在原校园北（现学府胡同），另建学院大门，座南向北。校门分内外两道。河北农学院东校门（1956年）保定解放后，河北农学院原校址改为中共冀中区党校使用。河北农学院先是暂驻在南关天主教淑慎女中，后政府拨出省立农事试验场做为建院的校基（原曹锟花园）。
1958年6月，经省委批准河北农学院更名为河北农业大学，7月，省委办公厅决定将西下关原省立农学院旧址移交河北农大。
1966年河北大学从天津迁到保定。
1975年8月，河北省革命委员会指示学习朝阳农学院经验，将学校搬到农村，河北农业大学总校本部迁到石家庄地区获鹿县牛山，校名为河北农业大学革命委员会总校，校总部建在山坡上。学校“一分为五”，分别在衡水地区前磨头、邯郸地区永年县、唐山地区昌黎县、沧州市水利专科学校。
“文革”后，拨乱反正，总校、分校迁回保定原址，恢复原校名。
改革开放以来，河北农大得到飞速发展，与河北林学院合并，在林学院原校河北农业大学西门（1988年）址基础上扩建建成了西校区。学校拥有保定校区、渤海校区、秦皇岛校区、定州校区，形成了“一校四地五区”办学的布局。
2012年成功入选国家教育部中西部100所工程大学，成功进入继985、211后国家第三阶梯大学行列。
河北农业大学先后经历了直隶农务学堂、直隶高等农业学堂、河北省立农学院、河北农业大学等历史时期。河北农业大学为河北省与中华人民共和国农业部共建高校（省部共建制）并逐步计划备案申报“华北农业大学”。武汉，参与组建了武汉水利水电学院（现与国立武汉大学合并）
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